2001
逐步落實本校二零零一至零七年的策略性發展計劃。

理大宣佈成立「香港專上學院」，提供副學士學位課程。

2002
首次取錄非本地學生修讀學位課程，該批學生分別來自歐洲及亞洲。

一萬一千二百七十三名理大學生、校友、員工及其親屬齊集香港大球場，一起砌出世界上最大的彩虹圖案，以慶祝香港理工大學建校六十五周年。是項紀錄獲《健力士世界紀錄大全》確認。

第三個海外員生會在澳洲成立。

學生宿舍正式啟用，理大發展全人教育亦進入了新里程。

2003
由理大院士伍士銓醫生和理大科研人員合力開發的一組太空儀器「岩芯取樣器」，是年隨歐洲太空總署的「獵犬二號」登陸船升空，遠征火星。

2004
理大與深圳市高新技術產業園區簽訂協議，成為首所正式入駐深圳虛擬大學園國家大學科技園香港院校產學研基地的本地院校。

理大第四個海外員生組織香港理工大學（美東）員生會於美國成立。

理大獲大學教育資助委員會轄下的「按表現及角色撥款計劃」額外撥款，肯定了理大以應用為本的教學與科研工作的表現。這次只有理大及另外兩間大學獲額外撥款。

2005
2005年，理大獲國家科學技術部正式批准，在本校設於深圳的現代中藥研究所，建立全國首個從事中藥開發、也是首個由香港院校設於內地的的國家重點實驗室培育基地，專門研究中藥藥劑與藥理學。

12.9.2005
國家副主席曾慶紅到訪理大，參觀功能性及智慧型紡織品及成衣納米科技中心，瞭解納米科技的最新發展；他並見證了本校和北京理工大學合作協議的簽訂。

9.2.1006
理大第五個海外員生會於新加坡成立。

10.5.2006
理大與中國奧委會科教部簽訂協議，成為「中國奧委會備戰二零零八年奧運會科技合作夥伴」。理大將派出醫療及社會科學院的專家，協助國家奧委會為選手備戰北京奧運。

12.5.2006
理大獲國家對外漢語教學領導小組辦公室授權，正式開辦香港唯一的孔子學院，致力推廣漢語及弘揚中國文化。

4.7.2006
理大發展基金正式成立。

14.11.2006
理大第六個海外員生會於美國北加州正式成立。

2007
理大轄下的香港專上學院位於紅磡灣的新校舍舉行平頂儀式。